在很久以前的一個村莊里，有一個婦人，非常希望有一個小寶寶。 于是她就去請求魔法師，魔法師就送給她一粒種子，并且對她說： “把它種到土里吧，就能達成你的愿望。”婦人才剛把種子種下，這個神奇的種子，馬上就開出了一個郁金香的花苞。 “哇！好漂亮的花苞！” 婦人情不自禁的吻了一下花苞，花苞就自己打開了，而且里面還有一個又小又可愛的女娃娃。 小女孩長得十分可愛，但是只有拇指般的大小，因此就取名為“拇指仙童”吧！ 白天，她以桌上的盤子作池塘，用花瓣當小船來游玩。 到了晚上，拇指仙童就舒舒服服地睡在胡桃做的搖籃里，作著甜蜜的夢。 有一天晚上一只蟾蜍潛進了婦人的房間，它一見到拇指仙童就十分喜歡，心想：“讓我把她帶回去，嫁給我兒子吧！” 于是，蟾蜍就把胡桃搖籃和拇指仙童，偷偷地帶回家了。 到了早上，拇指仙童醒了過來，發現自己睡在蓮葉上時，嚇了一大跳。 而且，她一聽說要嫁給蟾蜍時，更是嚇得傷心的哭了起來。 “好可憐喔！我們來幫助她吧！”小魚兒知道了拇指仙童的遭遇后，都十分的同情她。 他們合力咬斷了蓮花葉，蓮花葉慢慢地漂流開了，拇指仙童感激地說：“謝謝你們！” 拇指仙童在河上漂來漂去。 這時候，遇到了蝴蝶姑娘，蝴蝶姑娘十分熱心的說：“我也來幫忙吧！” 于是，它用帶子把拇指仙童乘坐的蓮花葉，拉到了岸邊。 突然，飛來了一只金龜子，把拇指仙童抓走了。 拇指仙童好不容易從蟾蜍那兒逃走，卻又被金龜子捉走了。 金龜子將她帶到森林里的一棵大樹上，并且神氣地對同伴說：“我撿到了一個可愛的小女孩！” 但是，金龜的伙伴們卻說：“哎呀！他只有二只腳！”“而且她沒有胡子，真是難看極了！” 所以，金龜子們都很討厭她，丟下了拇指仙童，就都跑掉了。 拇指仙童被丟棄在森林里，她吃花蜜，睡花葉，喝露水，孤單的過日子。 不久，冬天來臨來了，天空飄著雪，花草也都枯萎了，拇指仙童沒有食物可吃，只有以枯葉裹身，但是仍然寒風刺骨。 拇指仙童又餓又冷地在森林中徘徊，心想：“啊！好冷喔，肚子又餓，這樣子下去，非餓死不可！” 拇指仙童一面打哆嗦，一面在雪中前進；終于，她發現了一間野鼠婆婆住的房子。 野鼠婆婆看見拇指仙童，十分同情的說：“好可憐啊！快進來吃點東西！” 于是，拇指仙童就在野鼠婆婆的家住了下來，每天幫野鼠婆婆做許多家事，過著快樂的日子。 有一天，拇指仙童發現了一只生病的燕子。 拇指仙童就用枯草編成毯子，而且塞入棉花，來為生病的燕子取暖，還用花瓣收集露水，來給燕子喝。

“可憐的燕子啊！你要早日康復唷！”一整個冬天，拇指仙童都無微不至的在照顧生病的燕子，希望他早日康復。 不久，春天來臨了。 燕子也在拇指仙童仔細的照顧下，很快地康復了。 “謝謝你！拇指仙童，我要回到綠色森林去了，再見！” 野鼠婆婆的隔壁，住著一只有錢的鼴鼠，他很喜歡拇指仙童，要娶她做新娘，野鼠婆婆也贊成的說：“鼴鼠先生很有錢，你真是幸運啊！” 但是拇指仙童真的不想嫁給鼴鼠，她想；生活在土地里，看不到陽光，也看不到花朵；那是多么單調的世界啊！ 于是，她十分悲傷的哭泣著。 結婚的日子終于來臨了，拇指仙童站在野鼠婆婆的門口向太陽告別：“親愛的太陽公公，再見了。” 他十分悲傷的哭著，引來了那只曾經被救的燕子，燕子說：“走吧！和我一起走吧！我可以帶你到一個很快樂、很美好的地方去！” “謝謝、謝謝你來接我。”于是拇指仙童坐上燕子的背部，飛向一個溫暖之國。 溫暖的國度里，開滿了美麗的花；燕子將拇指仙童放在一朵最美麗的花上面，在那里站著一位小小的花王子，花王子十分喜歡拇指仙童，并且向她求婚：“拇指仙童，請你嫁給我吧！” “嗯……”拇指仙童也害羞地點頭答應了；于是，花仙子們都很高興，送給她一對翅膀，作為禮物。 從此，拇指仙童也能在花間飛來飛去，和王子過著快樂的日子。